mira, yo no sé si recomendar, pero te cuento con qué trabajo, a ver si es que te sirve.
aunque moho perfectamente puede trabajar solito, sin ayuda, es interesante usar objetos tridimensionales en las animaciones (en .obj). si no sabes mucho puedes usar el wings3d (que recomiendan acá mismo), que está re útil para eso. otro programa maravilloso es el Teddy y la mayoría de los de ese tal Takeo Igarashi (bájate el teddy y el chameleon. quizá no te sirvan, pero te vas a divertir un montón). para crear fondos los vectores nunca han sido muy amistosos, yo prefiero ocupar imágenes png transparentes.
acá mismo alguien recomendó (lo siento, no recuerdo quién) el artrage, que es un programa que es casi como pintar con acrílicos (y si tienes un lapicito mouse es fantástico).
un buen editor de imágenes como el photoshop (aunque la verdad es que odio photoshop) te puede servir también. yo uso el corel photopaint, que viene con el corel draw.
bueno, teniendo esto ya no se necesita más, creo. espero que te sirva.
oye, y gracias por lo del concurso, tengo un par de cositas que me gustaría mandar.
ah, y un editor de video te serviría, para unir las escenas. yo uso el adobe premiere, pero puede ser cualquiera.
http://www.wings3d.com
http://www-ui.is.s.u-tokyo.ac.jp/~takeo/
http://www.ambientdesign.com/artragedown.html
eso, por ahí nos vemos.